新冠病毒或可整合“插入”人类基因组?PNAS发表新论文,引发激烈学术争议

Evelyn Zhang

新冠感染中尚未解决的一个问题是,在缺乏病毒复制证据的情况下,患者在最初感染数周后,通过PCR检测到的病毒RNA往往仍呈阳性。

一项新的研究表明,新冠病毒RNA可以逆转录并整合“插入”到受感染细胞的基因组中,并以病毒与细胞序列融合的嵌合转录本表达。

病毒

研究人员们发现病毒序列的侧翼有目标位点重复,整合位点上有一致的LINE1内切酶识别序列,与LINE1逆转录转座子介导的、目标引导的逆转录和逆转录的机制一致。

重要的是,这种嵌合转录物可以在患者来源的组织中检测到。他们的数据表明,在一些患者组织中,大多数病毒转录本来自于整合序列。

研究人员表示,这些数据为了解新冠病毒感染的后果提供了一个见解,这可能有助于解释为什么患者在康复后可以继续产生病毒RNA。

今天,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了上述研究论文,题为“逆转录的SARS-CoV-2 RNA可以整合到培养的人类细胞基因组中,并可以在患者来源的组织中表达”(Reverse-transcribed SARS-CoV-2 RNA can integrate into the genome of cultured human cells and can be expressed in patient-derived tissues)。

这个发现来自两位麻省理工学院(MIT)的知名科学家:干细胞生物学家Rudolf Jaenisch教授和基因调控专家Richard Young教授,他们也都是美国科学院的院士。去年12月,他们在预印本网站上发表了初步的实验结果,遭致大量批评。

有科学家表示,正常情况下人体细胞中LINE-1水平较低,因此发生逆转录的概率较小;并且该研究仅仅开展了体外细胞实验,而在新冠感染者体内尚未发现新冠病毒RNA逆转录的现象,因此该研究临床意义或许不大。

在听取了批评意见后,他们补做了一些实验,并认为“我们现在有明确的证据表明冠状病毒序列可以整合到基因组中”。

目前,一些最初的批评者也转而支持他们的结论。而另一些批评者虽然认为这篇论文比预印本要更具可信度一些,但数据依然不算非常清晰。另外,在人类细胞中取得的数据是否对人类健康或是诊断有意义,也还需要进一步阐明。

译/前瞻经济学人APP资讯组

论文链接:https://www.pnas.org/content/118/21/e2105968118

https://www.pnas.org/content/pnas/118/21/e2105968118.full.pdf

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