福奇博士:新冠病毒Delta突变株构成新的最大威胁

Hanson临床科研

作者|王宇歌  来源|Hanson临床科研(ID:HClinicalResearch)

福奇博士忧虑Delta突变株

2021年6月21日,白宫首席医学顾问、美国国立卫生研究院(NIH)过敏和传染病研究所所长福奇博士(Dr. Fauci)表示,新冠病毒Delta突变株(B.1.617.2,即印度第二代突变株)构成新的最大威胁。

福奇博士的这个论断是基于最新的病毒株测序显示,最近两周(截止到6月19日),Delta突变株已经占到美国感染新冠毒株的20%;而两周前(6月5日)仅仅为10%。

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(credit: Leigh Vogel | Bloomberg | Getty Images)

福奇博士的忧虑更来自于英国目前发生的疫情持续恶化现状。

英国的单剂疫苗接种率已达65%,高于美国;但从5月8日发现15位接种阿斯利康疫苗者感染了Delta突变株后,立即将其定义重点关注突变株(VOC),并一再推迟重新开放;但仍然无法阻止Delta突变株的蔓延。目前Delta突变株已经占到了英国检出病毒株的95%以上,并且导致英国感染和病死人数均再次持续增长。

最近两周,英国平均新增感染人数较两周前增长了91%,病死人数增长了25%。

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2021年6月21日,Helix公司在medRxiv上传了一篇文章,对福奇博士的论断做出佐证。

该研究指出,Alpha突变株(B.1.1.7)的感染比例在美国迅速下降,从4月的70%,降到了6周后的42%。相比之下,Delta(B.1.617.2)和Gamma(P.1)突变株占比迅速上升。目前Delta的增长速率为0.61,Gamma为0.22。

Delta快速增长中也显示出“欺软怕硬”的特征。即Delta突变株在疫苗接种率低的地区快速蔓延,而在疫苗接种率高的地区则蔓延较慢。

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2021年6月22日(刚刚),Trevor Bedford更新了美国突变株流行情况。

目前美国95%新检出感染为较严重的VOC突变株感染。Delta在各个主要州以0.26-0.56/周的速率增长。目前每日新增病例中Alpha(B.1.1.7)约为5000例,Delta接近2000例。其他突变株传播系数Rt基本都低于1;而Delta明显高于1,目前主要在未接种疫苗人群中流行。

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(主要州的不同突变株变化情况,紫色为Delta突变株)

图片

(Delta突变株的Rt高于1)

Delta突变株到底有多厉害?

Delta突变株是印度第二代突变株B.1.617.2。其传播性比Alpha突变株还高60%,对中和抗体的抵抗特征与最高的B.1.351类似。

B.1.617突变株具有共同的特征性S抗原(包括RBD内)突变D111D,G142D,D614G,L452R,E484Q和P681R。对Furin(弗林蛋白酶)切割位点和RBD突变L452R,E484Q以及P681R进行结构分析,发现这些突变可能导致RBD与ACE2结合能力增加,S1-S2切割的速率增加,由此导致病毒复制能力和传染性增强。

相比第一代印度突变株B.1.617,第二代突变株B.1.617.2(即Delta突变株)的突变数量显著增加;尤其是S抗原内增加了大量突变。它虽然没有B.1.617的E484Q,但增加了新突变T478K(下图)。

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(印度突变株第二代与第一代的差别)

2021年6月13日,Eric Topol在推特更新总结了有四种世界卫生组织重点关注突变株(VOC)的特征。

Delta突变株具有高于Alpha(B.1.1.7)突变株的传播特征、和与B.1.351类似最高的对中和抗体的抵抗特征。

该表格还总结了在四种突变株流行的环境中进行过测试的疫苗,结果显示,目前已有的疫苗中,仍有疫苗对预防上述四周突变株有足够的保护力;但部分疫苗保护力则明显不足。

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(图源:Eric Topol推特)

如果应对Delta突变株?

2021年6月14日,Lancet发表了爱丁堡大学重磅文章报道了在苏格兰地区接种阿斯利康和辉瑞/BioTech疫苗对预防Delta突变株(第二代印度突变株B.1.617.2)的真实世界保护力。

研究分析了EAVE II系统今年4月1日至6月6日19,543个SARS-CoV-2感染病例和377个住院病历,指出疫苗接种的保护力在第一剂接种后28天后显现出来,研究应用S基因阳性PCR鉴别突变株和非突变株感染,发现:接种两剂辉瑞/BioTech疫苗对非突变株的保护力为92%,对预防感染Delta突变株保护力为79%;阿斯利康疫苗对非突变株保护力为73%,对预防感染Delta突变株保护力为60%。

疫苗对于人类的保护力不仅仅局限于预防感染Delta突变株,更在于降低病情危重和病死。

根据英国公共卫生部的数据,英国目前使用的阿斯利康疫苗和辉瑞疫苗对预防Delta突变株感染住院的保护力均超过90%。

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(4个需要“重点关注的突变株”)

6月21日,世界卫生组织(WHO)公布,Delta突变株已经蔓延到了世界上92个国家/地区。

Trevor Bedford刚刚发表的美国疫情进展情况,既显示了令人忧虑的显示,更给出了问题的关键:Delta突变株目前主要在未接种疫苗人群中流行。

对于应对方案,Helix的Dr. Lee说:

"At the end of the day, being vaccinated is still the best -- and potentially, at this point, the only -- tool we have," 

归根到底,疫苗接种仍然是我们最好、也是目前唯一的工具。

参考文献来源:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.06.20.21259195v1.full.pdf

https://en.wikipedia.org/wiki/SARS-CoV-2_Delta_variant

https://www.cnbc.com/2021/06/22/fauci-declares-delta-variant-greatest-threat-to-the-nations-efforts-to-eliminate-covid.html

编者按:本文转载自微信公众号:Hanson临床科研(ID:HClinicalResearch),作者:王宇歌 博士

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